Red Faction: Armageddon verlagert das Geschehen unter die Oberfläche des Mars, während das Schicksal des gesamten Planeten in der Schwebe hängt. Die Spieler werden als Darius Mason kämpfen, um die Menschheit vor der größten Bedrohung zu retten, die es je gab.

Ein halbes Jahrhundert, nachdem die Red Faction-Widerstandsgruppe den Mars befreien konnte, wird der Planet erneut zum Schlachtfeld. Die Kolonisten kämpfen in den unterirdischen Minen ums Überleben, denn die Oberfläche ist mittlerweile unbewohnbar geworden. Als Darius Mason, der Enkel der Revolutions-Helden Alec Mason und Samanya, versehentlich das Böse aus seinem urlangen Schlaf weckt, läutet dies das Armageddon auf dem Mars ein.

Nur Darius und die Red Faction-Gruppe sind fähig, die Menschen in den verschiedenen Untergrundsiedlungen zu retten. Der Kampf wird die Protagonisten ins Herz des von Stürmen zerstörten Planeten führen: Sie werden dabei Lava-Ströme bezwingen und Eis-Höhlen durchqueren müssen, um schließlich der schier unfassbaren Bedrohung von Angesicht zu Angesicht gegenüber zu treten. Red Faction: Armageddon erweitert die renommierte Bestseller-Reihe mit neuen, spektakulären Herausforderungen. Sie sind die letzte Hoffnung der Menschheit